Συνήθως ο υπερηχογραφικός έλεγχος γίνεται 4η-5η ημέρα του κύκλου ενδοκολπικά. Με την εξέταση αυτή βλέπουμε αφενός μεν τη μορφολογία της μήτρας (εάν έχει ινομυώματα, κτλ), τις ωοθήκες, μετράμε τον όγκο των ωοθηκών και βλέπουμε επίσης τις καταβολές των ωοθυλακίων που φαίνονται (αυτός είναι ένας επιπλέον δείκτης για το δυναμικό της ωοθήκης σε ωοθυλάκια και ωάρια).